Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc160Q3UYG1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc160Q3UYG1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms