Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW12

Cnga4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga4Q3UW12 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnga4Q3UW12 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnga4Q3UW12 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnga4Q3UW12 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnga4Q3UW12 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnga4Q3UW12 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnga4Q3UW12 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnga4Q3UW12 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnga4Q3UW12 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnga4Q3UW12 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnga4Q3UW12 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnga4Q3UW12 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnga4Q3UW12 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnga4Q3UW12 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnga4Q3UW12 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnga4Q3UW12 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnga4Q3UW12 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnga4Q3UW12 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnga4Q3UW12 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnga4Q3UW12 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnga4Q3UW12 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnga4Q3UW12 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnga4Q3UW12 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnga4Q3UW12 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnga4Q3UW12 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnga4Q3UW12 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnga4Q3UW12 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnga4Q3UW12 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnga4Q3UW12 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnga4Q3UW12 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnga4Q3UW12 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnga4Q3UW12 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnga4Q3UW12 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnga4Q3UW12 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnga4Q3UW12 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnga4Q3UW12 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnga4Q3UW12 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnga4Q3UW12 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnga4Q3UW12 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnga4Q3UW12 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnga4Q3UW12 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnga4Q3UW12 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnga4Q3UW12 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnga4Q3UW12 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnga4Q3UW12 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnga4Q3UW12 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnga4Q3UW12 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnga4Q3UW12 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnga4Q3UW12 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnga4Q3UW12 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnga4Q3UW12 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnga4Q3UW12 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnga4Q3UW12 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnga4Q3UW12 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnga4Q3UW12 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnga4Q3UW12 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnga4Q3UW12 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnga4Q3UW12 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnga4Q3UW12 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnga4Q3UW12 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnga4Q3UW12 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnga4Q3UW12 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnga4Q3UW12 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnga4Q3UW12 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnga4Q3UW12 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnga4Q3UW12 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnga4Q3UW12 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnga4Q3UW12 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnga4Q3UW12 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnga4Q3UW12 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnga4Q3UW12 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnga4Q3UW12 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnga4Q3UW12 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnga4Q3UW12 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnga4Q3UW12 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnga4Q3UW12 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnga4Q3UW12 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnga4Q3UW12 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnga4Q3UW12 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnga4Q3UW12 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnga4Q3UW12 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnga4Q3UW12 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnga4Q3UW12 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnga4Q3UW12 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnga4Q3UW12 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnga4Q3UW12 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnga4Q3UW12 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnga4Q3UW12 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnga4Q3UW12 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cnga4Q3UW12 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Cnga4Q3UW12 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cnga4Q3UW12 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cnga4Q3UW12 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cnga4Q3UW12 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cnga4Q3UW12 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cnga4Q3UW12 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cnga4Q3UW12 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cnga4Q3UW12 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cnga4Q3UW12 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cnga4Q3UW12 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms