Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU67

Trat1, T-cell receptor-associated transmembrane adapter 1, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trat1Q3UU67 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trat1Q3UU67 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trat1Q3UU67 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trat1Q3UU67 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trat1Q3UU67 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trat1Q3UU67 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trat1Q3UU67 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trat1Q3UU67 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trat1Q3UU67 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trat1Q3UU67 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trat1Q3UU67 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trat1Q3UU67 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trat1Q3UU67 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trat1Q3UU67 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trat1Q3UU67 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trat1Q3UU67 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trat1Q3UU67 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trat1Q3UU67 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trat1Q3UU67 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trat1Q3UU67 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trat1Q3UU67 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trat1Q3UU67 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trat1Q3UU67 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trat1Q3UU67 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trat1Q3UU67 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trat1Q3UU67 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trat1Q3UU67 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trat1Q3UU67 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trat1Q3UU67 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trat1Q3UU67 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trat1Q3UU67 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trat1Q3UU67 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trat1Q3UU67 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trat1Q3UU67 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trat1Q3UU67 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trat1Q3UU67 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trat1Q3UU67 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trat1Q3UU67 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trat1Q3UU67 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trat1Q3UU67 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trat1Q3UU67 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trat1Q3UU67 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trat1Q3UU67 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trat1Q3UU67 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trat1Q3UU67 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trat1Q3UU67 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trat1Q3UU67 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trat1Q3UU67 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trat1Q3UU67 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trat1Q3UU67 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trat1Q3UU67 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trat1Q3UU67 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trat1Q3UU67 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trat1Q3UU67 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trat1Q3UU67 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trat1Q3UU67 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trat1Q3UU67 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trat1Q3UU67 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trat1Q3UU67 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trat1Q3UU67 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trat1Q3UU67 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trat1Q3UU67 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trat1Q3UU67 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trat1Q3UU67 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trat1Q3UU67 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trat1Q3UU67 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trat1Q3UU67 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trat1Q3UU67 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trat1Q3UU67 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trat1Q3UU67 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trat1Q3UU67 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trat1Q3UU67 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trat1Q3UU67 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trat1Q3UU67 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trat1Q3UU67 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trat1Q3UU67 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trat1Q3UU67 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trat1Q3UU67 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trat1Q3UU67 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trat1Q3UU67 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trat1Q3UU67 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trat1Q3UU67 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trat1Q3UU67 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trat1Q3UU67 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trat1Q3UU67 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trat1Q3UU67 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trat1Q3UU67 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trat1Q3UU67 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trat1Q3UU67 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trat1Q3UU67 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trat1Q3UU67 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trat1Q3UU67 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trat1Q3UU67 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trat1Q3UU67 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trat1Q3UU67 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trat1Q3UU67 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trat1Q3UU67 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trat1Q3UU67 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trat1Q3UU67 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trat1Q3UU67 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms