Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Znf48Q3US17 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Znf48Q3US17 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Znf48Q3US17 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
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Znf48Q3US17 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Znf48Q3US17 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Znf48Q3US17 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Znf48Q3US17 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Znf48Q3US17 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Znf48Q3US17 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Znf48Q3US17 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Znf48Q3US17 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Znf48Q3US17 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Znf48Q3US17 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Znf48Q3US17 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Znf48Q3US17 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Znf48Q3US17 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Znf48Q3US17 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Znf48Q3US17 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Znf48Q3US17 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Znf48Q3US17 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Znf48Q3US17 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Znf48Q3US17 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Znf48Q3US17 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Znf48Q3US17 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Znf48Q3US17 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Znf48Q3US17 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Znf48Q3US17 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Znf48Q3US17 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Znf48Q3US17 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Znf48Q3US17 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Znf48Q3US17 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Znf48Q3US17 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Znf48Q3US17 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Znf48Q3US17 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Znf48Q3US17 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Znf48Q3US17 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Znf48Q3US17 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Znf48Q3US17 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Znf48Q3US17 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Znf48Q3US17 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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