Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULQ2

Pin1rt1, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin1rt1Q3ULQ2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pin1rt1Q3ULQ2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pin1rt1Q3ULQ2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pin1rt1Q3ULQ2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pin1rt1Q3ULQ2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pin1rt1Q3ULQ2 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pin1rt1Q3ULQ2 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pin1rt1Q3ULQ2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pin1rt1Q3ULQ2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pin1rt1Q3ULQ2 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pin1rt1Q3ULQ2 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pin1rt1Q3ULQ2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pin1rt1Q3ULQ2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pin1rt1Q3ULQ2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pin1rt1Q3ULQ2 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pin1rt1Q3ULQ2 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pin1rt1Q3ULQ2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pin1rt1Q3ULQ2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pin1rt1Q3ULQ2 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pin1rt1Q3ULQ2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pin1rt1Q3ULQ2 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pin1rt1Q3ULQ2 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pin1rt1Q3ULQ2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms