Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULD5

Mccc2, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mccc2Q3ULD5 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mccc2Q3ULD5 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mccc2Q3ULD5 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mccc2Q3ULD5 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mccc2Q3ULD5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mccc2Q3ULD5 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mccc2Q3ULD5 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Mccc2Q3ULD5 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mccc2Q3ULD5 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mccc2Q3ULD5 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mccc2Q3ULD5 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mccc2Q3ULD5 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mccc2Q3ULD5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mccc2Q3ULD5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mccc2Q3ULD5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mccc2Q3ULD5 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mccc2Q3ULD5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mccc2Q3ULD5 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mccc2Q3ULD5 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mccc2Q3ULD5 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mccc2Q3ULD5 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mccc2Q3ULD5 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mccc2Q3ULD5 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mccc2Q3ULD5 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mccc2Q3ULD5 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mccc2Q3ULD5 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mccc2Q3ULD5 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mccc2Q3ULD5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mccc2Q3ULD5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mccc2Q3ULD5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mccc2Q3ULD5 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mccc2Q3ULD5 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mccc2Q3ULD5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mccc2Q3ULD5 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mccc2Q3ULD5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mccc2Q3ULD5 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mccc2Q3ULD5 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mccc2Q3ULD5 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mccc2Q3ULD5 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mccc2Q3ULD5 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Mccc2Q3ULD5 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mccc2Q3ULD5 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mccc2Q3ULD5 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mccc2Q3ULD5 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mccc2Q3ULD5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mccc2Q3ULD5 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mccc2Q3ULD5 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mccc2Q3ULD5 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mccc2Q3ULD5 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mccc2Q3ULD5 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mccc2Q3ULD5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Mccc2Q3ULD5 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mccc2Q3ULD5 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mccc2Q3ULD5 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mccc2Q3ULD5 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mccc2Q3ULD5 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mccc2Q3ULD5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mccc2Q3ULD5 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mccc2Q3ULD5 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mccc2Q3ULD5 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mccc2Q3ULD5 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mccc2Q3ULD5 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mccc2Q3ULD5 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mccc2Q3ULD5 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mccc2Q3ULD5 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mccc2Q3ULD5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mccc2Q3ULD5 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mccc2Q3ULD5 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mccc2Q3ULD5 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mccc2Q3ULD5 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mccc2Q3ULD5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mccc2Q3ULD5 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mccc2Q3ULD5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mccc2Q3ULD5 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mccc2Q3ULD5 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mccc2Q3ULD5 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Mccc2Q3ULD5 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mccc2Q3ULD5 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mccc2Q3ULD5 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mccc2Q3ULD5 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mccc2Q3ULD5 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Mccc2Q3ULD5 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Mccc2Q3ULD5 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mccc2Q3ULD5 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mccc2Q3ULD5 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mccc2Q3ULD5 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Mccc2Q3ULD5 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mccc2Q3ULD5 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mccc2Q3ULD5 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mccc2Q3ULD5 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mccc2Q3ULD5 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mccc2Q3ULD5 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mccc2Q3ULD5 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mccc2Q3ULD5 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mccc2Q3ULD5 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Mccc2Q3ULD5 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Mccc2Q3ULD5 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Mccc2Q3ULD5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mccc2Q3ULD5 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mccc2Q3ULD5 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms