Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHK3

Greb1, Protein GREB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,954 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Greb1Q3UHK3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Greb1Q3UHK3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Greb1Q3UHK3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Greb1Q3UHK3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Greb1Q3UHK3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Greb1Q3UHK3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Greb1Q3UHK3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Greb1Q3UHK3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Greb1Q3UHK3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Greb1Q3UHK3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Greb1Q3UHK3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Greb1Q3UHK3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Greb1Q3UHK3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Greb1Q3UHK3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Greb1Q3UHK3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Greb1Q3UHK3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Greb1Q3UHK3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Greb1Q3UHK3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Greb1Q3UHK3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Greb1Q3UHK3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Greb1Q3UHK3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Greb1Q3UHK3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Greb1Q3UHK3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Greb1Q3UHK3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Greb1Q3UHK3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Greb1Q3UHK3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Greb1Q3UHK3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Greb1Q3UHK3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Greb1Q3UHK3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Greb1Q3UHK3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Greb1Q3UHK3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Greb1Q3UHK3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Greb1Q3UHK3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Greb1Q3UHK3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Greb1Q3UHK3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Greb1Q3UHK3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Greb1Q3UHK3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Greb1Q3UHK3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Greb1Q3UHK3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Greb1Q3UHK3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Greb1Q3UHK3 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Greb1Q3UHK3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Greb1Q3UHK3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Greb1Q3UHK3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Greb1Q3UHK3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Greb1Q3UHK3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Greb1Q3UHK3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Greb1Q3UHK3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Greb1Q3UHK3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Greb1Q3UHK3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Greb1Q3UHK3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Greb1Q3UHK3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Greb1Q3UHK3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Greb1Q3UHK3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Greb1Q3UHK3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Greb1Q3UHK3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Greb1Q3UHK3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Greb1Q3UHK3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Greb1Q3UHK3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Greb1Q3UHK3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Greb1Q3UHK3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Greb1Q3UHK3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Greb1Q3UHK3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Greb1Q3UHK3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Greb1Q3UHK3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Greb1Q3UHK3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Greb1Q3UHK3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Greb1Q3UHK3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Greb1Q3UHK3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Greb1Q3UHK3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Greb1Q3UHK3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Greb1Q3UHK3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Greb1Q3UHK3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Greb1Q3UHK3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Greb1Q3UHK3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Greb1Q3UHK3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Greb1Q3UHK3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Greb1Q3UHK3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Greb1Q3UHK3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Greb1Q3UHK3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Greb1Q3UHK3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Greb1Q3UHK3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Greb1Q3UHK3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Greb1Q3UHK3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Greb1Q3UHK3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Greb1Q3UHK3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Greb1Q3UHK3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Greb1Q3UHK3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Greb1Q3UHK3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Greb1Q3UHK3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Greb1Q3UHK3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Greb1Q3UHK3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Greb1Q3UHK3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Greb1Q3UHK3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Greb1Q3UHK3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Greb1Q3UHK3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Greb1Q3UHK3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Greb1Q3UHK3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Greb1Q3UHK3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Greb1Q3UHK3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms