Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHB8

Ccdc177, Coiled-coil domain-containing protein 177, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc177Q3UHB8 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc177Q3UHB8 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms