Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFM5

Nom1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 854 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nom1Q3UFM5 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nom1Q3UFM5 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Nom1Q3UFM5 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nom1Q3UFM5 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nom1Q3UFM5 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nom1Q3UFM5 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nom1Q3UFM5 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nom1Q3UFM5 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nom1Q3UFM5 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nom1Q3UFM5 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nom1Q3UFM5 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nom1Q3UFM5 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nom1Q3UFM5 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nom1Q3UFM5 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nom1Q3UFM5 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nom1Q3UFM5 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nom1Q3UFM5 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Nom1Q3UFM5 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nom1Q3UFM5 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Nom1Q3UFM5 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nom1Q3UFM5 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nom1Q3UFM5 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nom1Q3UFM5 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nom1Q3UFM5 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nom1Q3UFM5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nom1Q3UFM5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nom1Q3UFM5 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nom1Q3UFM5 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nom1Q3UFM5 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Nom1Q3UFM5 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nom1Q3UFM5 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nom1Q3UFM5 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nom1Q3UFM5 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nom1Q3UFM5 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nom1Q3UFM5 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nom1Q3UFM5 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nom1Q3UFM5 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nom1Q3UFM5 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nom1Q3UFM5 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nom1Q3UFM5 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nom1Q3UFM5 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nom1Q3UFM5 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nom1Q3UFM5 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nom1Q3UFM5 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nom1Q3UFM5 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Nom1Q3UFM5 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nom1Q3UFM5 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nom1Q3UFM5 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nom1Q3UFM5 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nom1Q3UFM5 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nom1Q3UFM5 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nom1Q3UFM5 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Nom1Q3UFM5 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nom1Q3UFM5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nom1Q3UFM5 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nom1Q3UFM5 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nom1Q3UFM5 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nom1Q3UFM5 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Nom1Q3UFM5 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nom1Q3UFM5 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nom1Q3UFM5 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nom1Q3UFM5 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nom1Q3UFM5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nom1Q3UFM5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nom1Q3UFM5 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nom1Q3UFM5 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nom1Q3UFM5 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nom1Q3UFM5 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nom1Q3UFM5 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nom1Q3UFM5 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nom1Q3UFM5 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nom1Q3UFM5 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nom1Q3UFM5 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nom1Q3UFM5 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nom1Q3UFM5 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nom1Q3UFM5 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Nom1Q3UFM5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nom1Q3UFM5 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nom1Q3UFM5 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nom1Q3UFM5 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Nom1Q3UFM5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nom1Q3UFM5 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nom1Q3UFM5 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nom1Q3UFM5 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nom1Q3UFM5 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nom1Q3UFM5 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nom1Q3UFM5 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nom1Q3UFM5 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nom1Q3UFM5 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nom1Q3UFM5 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nom1Q3UFM5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nom1Q3UFM5 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nom1Q3UFM5 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nom1Q3UFM5 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nom1Q3UFM5 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nom1Q3UFM5 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Nom1Q3UFM5 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nom1Q3UFM5 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nom1Q3UFM5 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nom1Q3UFM5 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms