Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDR8

Yipf3, Protein YIPF3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf3Q3UDR8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Yipf3Q3UDR8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Yipf3Q3UDR8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Yipf3Q3UDR8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Yipf3Q3UDR8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Yipf3Q3UDR8 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Yipf3Q3UDR8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Yipf3Q3UDR8 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Yipf3Q3UDR8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms