Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ulk3Q3U3Q1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ulk3Q3U3Q1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ulk3Q3U3Q1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ulk3Q3U3Q1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ulk3Q3U3Q1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ulk3Q3U3Q1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ulk3Q3U3Q1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ulk3Q3U3Q1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ulk3Q3U3Q1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ulk3Q3U3Q1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ulk3Q3U3Q1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ulk3Q3U3Q1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ulk3Q3U3Q1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ulk3Q3U3Q1 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ulk3Q3U3Q1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ulk3Q3U3Q1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ulk3Q3U3Q1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ulk3Q3U3Q1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ulk3Q3U3Q1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ulk3Q3U3Q1 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ulk3Q3U3Q1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ulk3Q3U3Q1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ulk3Q3U3Q1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ulk3Q3U3Q1 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ulk3Q3U3Q1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ulk3Q3U3Q1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ulk3Q3U3Q1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ulk3Q3U3Q1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ulk3Q3U3Q1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ulk3Q3U3Q1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ulk3Q3U3Q1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ulk3Q3U3Q1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ulk3Q3U3Q1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ulk3Q3U3Q1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ulk3Q3U3Q1 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ulk3Q3U3Q1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ulk3Q3U3Q1 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ulk3Q3U3Q1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ulk3Q3U3Q1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ulk3Q3U3Q1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ulk3Q3U3Q1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ulk3Q3U3Q1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ulk3Q3U3Q1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ulk3Q3U3Q1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ulk3Q3U3Q1 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ulk3Q3U3Q1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ulk3Q3U3Q1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ulk3Q3U3Q1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ulk3Q3U3Q1 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ulk3Q3U3Q1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ulk3Q3U3Q1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ulk3Q3U3Q1 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ulk3Q3U3Q1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ulk3Q3U3Q1 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ulk3Q3U3Q1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ulk3Q3U3Q1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ulk3Q3U3Q1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ulk3Q3U3Q1 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ulk3Q3U3Q1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ulk3Q3U3Q1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ulk3Q3U3Q1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ulk3Q3U3Q1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ulk3Q3U3Q1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ulk3Q3U3Q1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ulk3Q3U3Q1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ulk3Q3U3Q1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ulk3Q3U3Q1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ulk3Q3U3Q1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ulk3Q3U3Q1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ulk3Q3U3Q1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ulk3Q3U3Q1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ulk3Q3U3Q1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ulk3Q3U3Q1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ulk3Q3U3Q1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ulk3Q3U3Q1 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ulk3Q3U3Q1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ulk3Q3U3Q1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ulk3Q3U3Q1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ulk3Q3U3Q1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ulk3Q3U3Q1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ulk3Q3U3Q1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ulk3Q3U3Q1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ulk3Q3U3Q1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ulk3Q3U3Q1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ulk3Q3U3Q1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ulk3Q3U3Q1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ulk3Q3U3Q1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ulk3Q3U3Q1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ulk3Q3U3Q1 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ulk3Q3U3Q1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ulk3Q3U3Q1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ulk3Q3U3Q1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ulk3Q3U3Q1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ulk3Q3U3Q1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ulk3Q3U3Q1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ulk3Q3U3Q1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ulk3Q3U3Q1 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ulk3Q3U3Q1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ulk3Q3U3Q1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms