Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc102aQ3TMW1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc102aQ3TMW1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc102aQ3TMW1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc102aQ3TMW1 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc102aQ3TMW1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc102aQ3TMW1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc102aQ3TMW1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc102aQ3TMW1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc102aQ3TMW1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc102aQ3TMW1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc102aQ3TMW1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc102aQ3TMW1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc102aQ3TMW1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc102aQ3TMW1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc102aQ3TMW1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc102aQ3TMW1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc102aQ3TMW1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc102aQ3TMW1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc102aQ3TMW1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc102aQ3TMW1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc102aQ3TMW1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc102aQ3TMW1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc102aQ3TMW1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc102aQ3TMW1 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc102aQ3TMW1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc102aQ3TMW1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc102aQ3TMW1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc102aQ3TMW1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc102aQ3TMW1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc102aQ3TMW1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc102aQ3TMW1 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc102aQ3TMW1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc102aQ3TMW1 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc102aQ3TMW1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc102aQ3TMW1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc102aQ3TMW1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc102aQ3TMW1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc102aQ3TMW1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc102aQ3TMW1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc102aQ3TMW1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc102aQ3TMW1 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc102aQ3TMW1 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc102aQ3TMW1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc102aQ3TMW1 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc102aQ3TMW1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc102aQ3TMW1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc102aQ3TMW1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc102aQ3TMW1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc102aQ3TMW1 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc102aQ3TMW1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc102aQ3TMW1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc102aQ3TMW1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc102aQ3TMW1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc102aQ3TMW1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc102aQ3TMW1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc102aQ3TMW1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc102aQ3TMW1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc102aQ3TMW1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc102aQ3TMW1 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc102aQ3TMW1 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc102aQ3TMW1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc102aQ3TMW1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc102aQ3TMW1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc102aQ3TMW1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc102aQ3TMW1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc102aQ3TMW1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc102aQ3TMW1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc102aQ3TMW1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc102aQ3TMW1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc102aQ3TMW1 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc102aQ3TMW1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc102aQ3TMW1 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc102aQ3TMW1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc102aQ3TMW1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc102aQ3TMW1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc102aQ3TMW1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc102aQ3TMW1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc102aQ3TMW1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc102aQ3TMW1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc102aQ3TMW1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc102aQ3TMW1 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc102aQ3TMW1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc102aQ3TMW1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc102aQ3TMW1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc102aQ3TMW1 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc102aQ3TMW1 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc102aQ3TMW1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc102aQ3TMW1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc102aQ3TMW1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc102aQ3TMW1 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc102aQ3TMW1 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc102aQ3TMW1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc102aQ3TMW1 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc102aQ3TMW1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc102aQ3TMW1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc102aQ3TMW1 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc102aQ3TMW1 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc102aQ3TMW1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms