Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNY5

Riiad1, RIIa domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riiad1Q3KNY5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms