Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPR5

Hdgfl1, Hepatoma-derived growth factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl1Q2VPR5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hdgfl1Q2VPR5 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Hdgfl1Q2VPR5 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hdgfl1Q2VPR5 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hdgfl1Q2VPR5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hdgfl1Q2VPR5 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hdgfl1Q2VPR5 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hdgfl1Q2VPR5 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hdgfl1Q2VPR5 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hdgfl1Q2VPR5 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hdgfl1Q2VPR5 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hdgfl1Q2VPR5 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hdgfl1Q2VPR5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hdgfl1Q2VPR5 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Hdgfl1Q2VPR5 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hdgfl1Q2VPR5 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hdgfl1Q2VPR5 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hdgfl1Q2VPR5 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hdgfl1Q2VPR5 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hdgfl1Q2VPR5 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hdgfl1Q2VPR5 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hdgfl1Q2VPR5 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hdgfl1Q2VPR5 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hdgfl1Q2VPR5 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hdgfl1Q2VPR5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hdgfl1Q2VPR5 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hdgfl1Q2VPR5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hdgfl1Q2VPR5 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hdgfl1Q2VPR5 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hdgfl1Q2VPR5 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hdgfl1Q2VPR5 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hdgfl1Q2VPR5 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hdgfl1Q2VPR5 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hdgfl1Q2VPR5 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hdgfl1Q2VPR5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hdgfl1Q2VPR5 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hdgfl1Q2VPR5 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hdgfl1Q2VPR5 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hdgfl1Q2VPR5 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hdgfl1Q2VPR5 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hdgfl1Q2VPR5 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hdgfl1Q2VPR5 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hdgfl1Q2VPR5 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Hdgfl1Q2VPR5 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Hdgfl1Q2VPR5 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hdgfl1Q2VPR5 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hdgfl1Q2VPR5 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hdgfl1Q2VPR5 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hdgfl1Q2VPR5 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hdgfl1Q2VPR5 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hdgfl1Q2VPR5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hdgfl1Q2VPR5 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hdgfl1Q2VPR5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hdgfl1Q2VPR5 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hdgfl1Q2VPR5 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hdgfl1Q2VPR5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hdgfl1Q2VPR5 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hdgfl1Q2VPR5 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hdgfl1Q2VPR5 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hdgfl1Q2VPR5 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hdgfl1Q2VPR5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hdgfl1Q2VPR5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hdgfl1Q2VPR5 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Hdgfl1Q2VPR5 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hdgfl1Q2VPR5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hdgfl1Q2VPR5 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hdgfl1Q2VPR5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hdgfl1Q2VPR5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Hdgfl1Q2VPR5 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hdgfl1Q2VPR5 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hdgfl1Q2VPR5 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hdgfl1Q2VPR5 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hdgfl1Q2VPR5 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hdgfl1Q2VPR5 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hdgfl1Q2VPR5 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Hdgfl1Q2VPR5 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hdgfl1Q2VPR5 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hdgfl1Q2VPR5 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hdgfl1Q2VPR5 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hdgfl1Q2VPR5 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Hdgfl1Q2VPR5 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hdgfl1Q2VPR5 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hdgfl1Q2VPR5 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hdgfl1Q2VPR5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hdgfl1Q2VPR5 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hdgfl1Q2VPR5 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Hdgfl1Q2VPR5 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Hdgfl1Q2VPR5 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Hdgfl1Q2VPR5 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hdgfl1Q2VPR5 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hdgfl1Q2VPR5 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hdgfl1Q2VPR5 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hdgfl1Q2VPR5 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hdgfl1Q2VPR5 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hdgfl1Q2VPR5 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hdgfl1Q2VPR5 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hdgfl1Q2VPR5 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hdgfl1Q2VPR5 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hdgfl1Q2VPR5 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Hdgfl1Q2VPR5 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms