Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKI2

Vax1, Ventral anterior homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax1Q2NKI2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vax1Q2NKI2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vax1Q2NKI2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vax1Q2NKI2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vax1Q2NKI2 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vax1Q2NKI2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vax1Q2NKI2 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vax1Q2NKI2 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vax1Q2NKI2 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vax1Q2NKI2 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vax1Q2NKI2 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Vax1Q2NKI2 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vax1Q2NKI2 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vax1Q2NKI2 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vax1Q2NKI2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vax1Q2NKI2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vax1Q2NKI2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vax1Q2NKI2 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vax1Q2NKI2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vax1Q2NKI2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vax1Q2NKI2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vax1Q2NKI2 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vax1Q2NKI2 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vax1Q2NKI2 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vax1Q2NKI2 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vax1Q2NKI2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vax1Q2NKI2 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vax1Q2NKI2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vax1Q2NKI2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vax1Q2NKI2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vax1Q2NKI2 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vax1Q2NKI2 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vax1Q2NKI2 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vax1Q2NKI2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vax1Q2NKI2 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vax1Q2NKI2 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vax1Q2NKI2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vax1Q2NKI2 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vax1Q2NKI2 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vax1Q2NKI2 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Vax1Q2NKI2 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vax1Q2NKI2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vax1Q2NKI2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vax1Q2NKI2 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vax1Q2NKI2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vax1Q2NKI2 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vax1Q2NKI2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vax1Q2NKI2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vax1Q2NKI2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Vax1Q2NKI2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vax1Q2NKI2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vax1Q2NKI2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vax1Q2NKI2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vax1Q2NKI2 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vax1Q2NKI2 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vax1Q2NKI2 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vax1Q2NKI2 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vax1Q2NKI2 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Vax1Q2NKI2 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Vax1Q2NKI2 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vax1Q2NKI2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vax1Q2NKI2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vax1Q2NKI2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vax1Q2NKI2 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vax1Q2NKI2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vax1Q2NKI2 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vax1Q2NKI2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vax1Q2NKI2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vax1Q2NKI2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vax1Q2NKI2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vax1Q2NKI2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vax1Q2NKI2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vax1Q2NKI2 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vax1Q2NKI2 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vax1Q2NKI2 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Vax1Q2NKI2 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Vax1Q2NKI2 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vax1Q2NKI2 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vax1Q2NKI2 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vax1Q2NKI2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vax1Q2NKI2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vax1Q2NKI2 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vax1Q2NKI2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vax1Q2NKI2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vax1Q2NKI2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vax1Q2NKI2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vax1Q2NKI2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vax1Q2NKI2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vax1Q2NKI2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vax1Q2NKI2 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vax1Q2NKI2 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vax1Q2NKI2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vax1Q2NKI2 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vax1Q2NKI2 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vax1Q2NKI2 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vax1Q2NKI2 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vax1Q2NKI2 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vax1Q2NKI2 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Vax1Q2NKI2 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vax1Q2NKI2 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms