Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cpne9Q1RLL3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cpne9Q1RLL3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cpne9Q1RLL3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cpne9Q1RLL3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cpne9Q1RLL3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cpne9Q1RLL3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cpne9Q1RLL3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cpne9Q1RLL3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cpne9Q1RLL3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cpne9Q1RLL3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cpne9Q1RLL3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cpne9Q1RLL3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cpne9Q1RLL3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cpne9Q1RLL3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cpne9Q1RLL3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cpne9Q1RLL3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cpne9Q1RLL3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cpne9Q1RLL3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cpne9Q1RLL3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cpne9Q1RLL3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cpne9Q1RLL3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cpne9Q1RLL3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cpne9Q1RLL3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cpne9Q1RLL3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cpne9Q1RLL3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cpne9Q1RLL3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cpne9Q1RLL3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cpne9Q1RLL3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cpne9Q1RLL3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cpne9Q1RLL3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cpne9Q1RLL3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cpne9Q1RLL3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cpne9Q1RLL3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cpne9Q1RLL3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cpne9Q1RLL3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cpne9Q1RLL3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cpne9Q1RLL3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cpne9Q1RLL3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cpne9Q1RLL3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cpne9Q1RLL3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cpne9Q1RLL3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cpne9Q1RLL3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cpne9Q1RLL3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cpne9Q1RLL3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cpne9Q1RLL3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cpne9Q1RLL3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cpne9Q1RLL3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Cpne9Q1RLL3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Cpne9Q1RLL3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cpne9Q1RLL3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cpne9Q1RLL3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cpne9Q1RLL3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cpne9Q1RLL3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cpne9Q1RLL3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cpne9Q1RLL3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cpne9Q1RLL3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cpne9Q1RLL3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cpne9Q1RLL3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cpne9Q1RLL3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cpne9Q1RLL3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cpne9Q1RLL3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cpne9Q1RLL3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cpne9Q1RLL3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cpne9Q1RLL3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cpne9Q1RLL3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cpne9Q1RLL3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cpne9Q1RLL3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cpne9Q1RLL3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cpne9Q1RLL3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cpne9Q1RLL3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cpne9Q1RLL3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cpne9Q1RLL3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cpne9Q1RLL3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cpne9Q1RLL3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cpne9Q1RLL3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cpne9Q1RLL3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cpne9Q1RLL3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cpne9Q1RLL3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cpne9Q1RLL3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cpne9Q1RLL3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cpne9Q1RLL3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cpne9Q1RLL3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cpne9Q1RLL3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cpne9Q1RLL3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cpne9Q1RLL3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cpne9Q1RLL3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cpne9Q1RLL3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cpne9Q1RLL3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cpne9Q1RLL3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Cpne9Q1RLL3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
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