Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trim71Q1PSW8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
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