Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ptchd1Q14B62 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ptchd1Q14B62 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ptchd1Q14B62 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ptchd1Q14B62 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ptchd1Q14B62 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ptchd1Q14B62 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ptchd1Q14B62 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ptchd1Q14B62 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ptchd1Q14B62 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ptchd1Q14B62 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ptchd1Q14B62 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ptchd1Q14B62 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ptchd1Q14B62 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ptchd1Q14B62 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ptchd1Q14B62 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ptchd1Q14B62 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ptchd1Q14B62 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ptchd1Q14B62 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ptchd1Q14B62 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ptchd1Q14B62 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ptchd1Q14B62 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ptchd1Q14B62 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms