Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpusd3Q14AI6 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpusd3Q14AI6 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpusd3Q14AI6 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpusd3Q14AI6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpusd3Q14AI6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpusd3Q14AI6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpusd3Q14AI6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpusd3Q14AI6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpusd3Q14AI6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpusd3Q14AI6 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpusd3Q14AI6 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpusd3Q14AI6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpusd3Q14AI6 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpusd3Q14AI6 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpusd3Q14AI6 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpusd3Q14AI6 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpusd3Q14AI6 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpusd3Q14AI6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpusd3Q14AI6 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpusd3Q14AI6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpusd3Q14AI6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpusd3Q14AI6 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpusd3Q14AI6 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpusd3Q14AI6 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpusd3Q14AI6 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpusd3Q14AI6 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpusd3Q14AI6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpusd3Q14AI6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpusd3Q14AI6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpusd3Q14AI6 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpusd3Q14AI6 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpusd3Q14AI6 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpusd3Q14AI6 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpusd3Q14AI6 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpusd3Q14AI6 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpusd3Q14AI6 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpusd3Q14AI6 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpusd3Q14AI6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpusd3Q14AI6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpusd3Q14AI6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpusd3Q14AI6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpusd3Q14AI6 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpusd3Q14AI6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpusd3Q14AI6 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpusd3Q14AI6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpusd3Q14AI6 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpusd3Q14AI6 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpusd3Q14AI6 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpusd3Q14AI6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpusd3Q14AI6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpusd3Q14AI6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpusd3Q14AI6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpusd3Q14AI6 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpusd3Q14AI6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpusd3Q14AI6 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpusd3Q14AI6 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpusd3Q14AI6 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpusd3Q14AI6 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpusd3Q14AI6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpusd3Q14AI6 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpusd3Q14AI6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpusd3Q14AI6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpusd3Q14AI6 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpusd3Q14AI6 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpusd3Q14AI6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpusd3Q14AI6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpusd3Q14AI6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpusd3Q14AI6 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpusd3Q14AI6 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpusd3Q14AI6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpusd3Q14AI6 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpusd3Q14AI6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpusd3Q14AI6 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpusd3Q14AI6 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpusd3Q14AI6 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpusd3Q14AI6 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpusd3Q14AI6 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpusd3Q14AI6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpusd3Q14AI6 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpusd3Q14AI6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpusd3Q14AI6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpusd3Q14AI6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpusd3Q14AI6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpusd3Q14AI6 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpusd3Q14AI6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpusd3Q14AI6 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpusd3Q14AI6 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpusd3Q14AI6 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpusd3Q14AI6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpusd3Q14AI6 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpusd3Q14AI6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpusd3Q14AI6 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpusd3Q14AI6 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpusd3Q14AI6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpusd3Q14AI6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpusd3Q14AI6 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpusd3Q14AI6 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpusd3Q14AI6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpusd3Q14AI6 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms