Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

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Length 617 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VgfQ0VGU4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VgfQ0VGU4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VgfQ0VGU4 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VgfQ0VGU4 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VgfQ0VGU4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VgfQ0VGU4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VgfQ0VGU4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VgfQ0VGU4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VgfQ0VGU4 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VgfQ0VGU4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VgfQ0VGU4 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VgfQ0VGU4 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VgfQ0VGU4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VgfQ0VGU4 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VgfQ0VGU4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VgfQ0VGU4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VgfQ0VGU4 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VgfQ0VGU4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VgfQ0VGU4 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VgfQ0VGU4 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VgfQ0VGU4 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VgfQ0VGU4 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VgfQ0VGU4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VgfQ0VGU4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VgfQ0VGU4 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
VgfQ0VGU4 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VgfQ0VGU4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VgfQ0VGU4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VgfQ0VGU4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VgfQ0VGU4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VgfQ0VGU4 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VgfQ0VGU4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VgfQ0VGU4 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VgfQ0VGU4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VgfQ0VGU4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VgfQ0VGU4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VgfQ0VGU4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VgfQ0VGU4 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VgfQ0VGU4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VgfQ0VGU4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VgfQ0VGU4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VgfQ0VGU4 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VgfQ0VGU4 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VgfQ0VGU4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VgfQ0VGU4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VgfQ0VGU4 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VgfQ0VGU4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VgfQ0VGU4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VgfQ0VGU4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VgfQ0VGU4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VgfQ0VGU4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VgfQ0VGU4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VgfQ0VGU4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VgfQ0VGU4 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VgfQ0VGU4 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VgfQ0VGU4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VgfQ0VGU4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VgfQ0VGU4 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
VgfQ0VGU4 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VgfQ0VGU4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VgfQ0VGU4 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VgfQ0VGU4 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VgfQ0VGU4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VgfQ0VGU4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VgfQ0VGU4 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VgfQ0VGU4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VgfQ0VGU4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VgfQ0VGU4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VgfQ0VGU4 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VgfQ0VGU4 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
VgfQ0VGU4 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VgfQ0VGU4 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VgfQ0VGU4 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VgfQ0VGU4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VgfQ0VGU4 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VgfQ0VGU4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VgfQ0VGU4 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VgfQ0VGU4 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VgfQ0VGU4 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
VgfQ0VGU4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VgfQ0VGU4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
VgfQ0VGU4 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VgfQ0VGU4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VgfQ0VGU4 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
VgfQ0VGU4 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
VgfQ0VGU4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VgfQ0VGU4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VgfQ0VGU4 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VgfQ0VGU4 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VgfQ0VGU4 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VgfQ0VGU4 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VgfQ0VGU4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VgfQ0VGU4 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VgfQ0VGU4 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VgfQ0VGU4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VgfQ0VGU4 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VgfQ0VGU4 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VgfQ0VGU4 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VgfQ0VGU4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms