Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ubxn2bQ0KL01 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ubxn2bQ0KL01 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ubxn2bQ0KL01 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ubxn2bQ0KL01 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ubxn2bQ0KL01 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ubxn2bQ0KL01 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ubxn2bQ0KL01 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ubxn2bQ0KL01 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ubxn2bQ0KL01 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ubxn2bQ0KL01 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ubxn2bQ0KL01 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ubxn2bQ0KL01 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ubxn2bQ0KL01 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ubxn2bQ0KL01 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ubxn2bQ0KL01 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ubxn2bQ0KL01 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ubxn2bQ0KL01 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ubxn2bQ0KL01 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ubxn2bQ0KL01 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ubxn2bQ0KL01 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ubxn2bQ0KL01 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ubxn2bQ0KL01 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ubxn2bQ0KL01 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ubxn2bQ0KL01 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ubxn2bQ0KL01 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ubxn2bQ0KL01 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Ubxn2bQ0KL01 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ubxn2bQ0KL01 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ubxn2bQ0KL01 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ubxn2bQ0KL01 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ubxn2bQ0KL01 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ubxn2bQ0KL01 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ubxn2bQ0KL01 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ubxn2bQ0KL01 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ubxn2bQ0KL01 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ubxn2bQ0KL01 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ubxn2bQ0KL01 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ubxn2bQ0KL01 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ubxn2bQ0KL01 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ubxn2bQ0KL01 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ubxn2bQ0KL01 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ubxn2bQ0KL01 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ubxn2bQ0KL01 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ubxn2bQ0KL01 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ubxn2bQ0KL01 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ubxn2bQ0KL01 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ubxn2bQ0KL01 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ubxn2bQ0KL01 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ubxn2bQ0KL01 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ubxn2bQ0KL01 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ubxn2bQ0KL01 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ubxn2bQ0KL01 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ubxn2bQ0KL01 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ubxn2bQ0KL01 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ubxn2bQ0KL01 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ubxn2bQ0KL01 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ubxn2bQ0KL01 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubxn2bQ0KL01 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubxn2bQ0KL01 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubxn2bQ0KL01 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubxn2bQ0KL01 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubxn2bQ0KL01 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubxn2bQ0KL01 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubxn2bQ0KL01 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubxn2bQ0KL01 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubxn2bQ0KL01 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubxn2bQ0KL01 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubxn2bQ0KL01 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubxn2bQ0KL01 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubxn2bQ0KL01 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubxn2bQ0KL01 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubxn2bQ0KL01 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubxn2bQ0KL01 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubxn2bQ0KL01 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubxn2bQ0KL01 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubxn2bQ0KL01 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubxn2bQ0KL01 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubxn2bQ0KL01 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubxn2bQ0KL01 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubxn2bQ0KL01 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubxn2bQ0KL01 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubxn2bQ0KL01 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubxn2bQ0KL01 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubxn2bQ0KL01 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubxn2bQ0KL01 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubxn2bQ0KL01 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubxn2bQ0KL01 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubxn2bQ0KL01 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubxn2bQ0KL01 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubxn2bQ0KL01 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubxn2bQ0KL01 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubxn2bQ0KL01 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubxn2bQ0KL01 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubxn2bQ0KL01 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubxn2bQ0KL01 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubxn2bQ0KL01 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubxn2bQ0KL01 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubxn2bQ0KL01 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubxn2bQ0KL01 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms