Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Gata4Q08369 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gata4Q08369 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms