Protein–RNA interactions for Protein: Q05A80

Caprin2, Caprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,031 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caprin2Q05A80 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Caprin2Q05A80 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Caprin2Q05A80 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Caprin2Q05A80 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Caprin2Q05A80 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Caprin2Q05A80 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Caprin2Q05A80 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Caprin2Q05A80 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Caprin2Q05A80 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Caprin2Q05A80 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Caprin2Q05A80 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Caprin2Q05A80 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Caprin2Q05A80 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Caprin2Q05A80 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Caprin2Q05A80 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Caprin2Q05A80 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Caprin2Q05A80 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Caprin2Q05A80 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Caprin2Q05A80 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Caprin2Q05A80 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Caprin2Q05A80 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Caprin2Q05A80 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Caprin2Q05A80 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Caprin2Q05A80 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Caprin2Q05A80 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Caprin2Q05A80 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Caprin2Q05A80 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Caprin2Q05A80 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Caprin2Q05A80 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Caprin2Q05A80 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Caprin2Q05A80 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Caprin2Q05A80 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Caprin2Q05A80 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Caprin2Q05A80 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Caprin2Q05A80 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Caprin2Q05A80 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Caprin2Q05A80 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Caprin2Q05A80 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Caprin2Q05A80 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Caprin2Q05A80 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Caprin2Q05A80 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Caprin2Q05A80 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Caprin2Q05A80 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Caprin2Q05A80 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Caprin2Q05A80 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Caprin2Q05A80 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Caprin2Q05A80 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Caprin2Q05A80 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Caprin2Q05A80 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Caprin2Q05A80 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Caprin2Q05A80 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Caprin2Q05A80 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Caprin2Q05A80 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Caprin2Q05A80 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Caprin2Q05A80 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Caprin2Q05A80 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Caprin2Q05A80 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Caprin2Q05A80 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Caprin2Q05A80 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Caprin2Q05A80 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Caprin2Q05A80 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Caprin2Q05A80 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Caprin2Q05A80 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Caprin2Q05A80 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Caprin2Q05A80 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Caprin2Q05A80 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Caprin2Q05A80 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Caprin2Q05A80 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Caprin2Q05A80 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Caprin2Q05A80 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Caprin2Q05A80 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Caprin2Q05A80 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Caprin2Q05A80 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Caprin2Q05A80 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Caprin2Q05A80 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Caprin2Q05A80 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Caprin2Q05A80 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Caprin2Q05A80 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Caprin2Q05A80 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Caprin2Q05A80 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Caprin2Q05A80 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Caprin2Q05A80 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Caprin2Q05A80 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Caprin2Q05A80 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Caprin2Q05A80 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Caprin2Q05A80 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Caprin2Q05A80 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Caprin2Q05A80 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Caprin2Q05A80 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Caprin2Q05A80 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Caprin2Q05A80 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Caprin2Q05A80 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Caprin2Q05A80 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Caprin2Q05A80 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Caprin2Q05A80 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Caprin2Q05A80 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Caprin2Q05A80 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Caprin2Q05A80 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Caprin2Q05A80 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Caprin2Q05A80 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms