Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sox12Q04890 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sox12Q04890 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sox12Q04890 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sox12Q04890 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sox12Q04890 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sox12Q04890 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sox12Q04890 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Sox12Q04890 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sox12Q04890 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sox12Q04890 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sox12Q04890 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Sox12Q04890 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sox12Q04890 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sox12Q04890 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sox12Q04890 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sox12Q04890 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sox12Q04890 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sox12Q04890 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sox12Q04890 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sox12Q04890 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sox12Q04890 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sox12Q04890 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sox12Q04890 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sox12Q04890 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sox12Q04890 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sox12Q04890 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sox12Q04890 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sox12Q04890 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sox12Q04890 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sox12Q04890 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Sox12Q04890 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sox12Q04890 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sox12Q04890 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sox12Q04890 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sox12Q04890 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Sox12Q04890 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Sox12Q04890 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sox12Q04890 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sox12Q04890 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sox12Q04890 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sox12Q04890 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sox12Q04890 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sox12Q04890 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sox12Q04890 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sox12Q04890 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sox12Q04890 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sox12Q04890 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sox12Q04890 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sox12Q04890 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sox12Q04890 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sox12Q04890 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sox12Q04890 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Sox12Q04890 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sox12Q04890 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Sox12Q04890 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sox12Q04890 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sox12Q04890 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Sox12Q04890 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sox12Q04890 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sox12Q04890 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sox12Q04890 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sox12Q04890 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sox12Q04890 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sox12Q04890 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sox12Q04890 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sox12Q04890 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sox12Q04890 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sox12Q04890 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sox12Q04890 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sox12Q04890 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sox12Q04890 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sox12Q04890 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sox12Q04890 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sox12Q04890 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sox12Q04890 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sox12Q04890 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sox12Q04890 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sox12Q04890 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sox12Q04890 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sox12Q04890 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Sox12Q04890 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sox12Q04890 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sox12Q04890 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sox12Q04890 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sox12Q04890 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sox12Q04890 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sox12Q04890 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sox12Q04890 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sox12Q04890 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sox12Q04890 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sox12Q04890 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sox12Q04890 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Sox12Q04890 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sox12Q04890 Gm38134-201ENSMUST00000191858 1234 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sox12Q04890 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sox12Q04890 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sox12Q04890 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Sox12Q04890 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sox12Q04890 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms