Protein–RNA interactions for Protein: Q04744

Emx2, Homeobox protein EMX2, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx2Q04744 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms