Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cxcr5Q04683 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cxcr5Q04683 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cxcr5Q04683 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cxcr5Q04683 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cxcr5Q04683 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cxcr5Q04683 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cxcr5Q04683 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cxcr5Q04683 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cxcr5Q04683 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cxcr5Q04683 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cxcr5Q04683 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cxcr5Q04683 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cxcr5Q04683 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cxcr5Q04683 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cxcr5Q04683 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cxcr5Q04683 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cxcr5Q04683 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cxcr5Q04683 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cxcr5Q04683 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cxcr5Q04683 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cxcr5Q04683 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Cxcr5Q04683 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cxcr5Q04683 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cxcr5Q04683 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cxcr5Q04683 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cxcr5Q04683 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cxcr5Q04683 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cxcr5Q04683 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cxcr5Q04683 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cxcr5Q04683 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cxcr5Q04683 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cxcr5Q04683 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cxcr5Q04683 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cxcr5Q04683 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cxcr5Q04683 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cxcr5Q04683 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms