Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Msx2Q03358 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Msx2Q03358 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Msx2Q03358 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Msx2Q03358 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Msx2Q03358 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Msx2Q03358 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Msx2Q03358 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msx2Q03358 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msx2Q03358 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Msx2Q03358 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msx2Q03358 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msx2Q03358 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msx2Q03358 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msx2Q03358 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msx2Q03358 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msx2Q03358 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msx2Q03358 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msx2Q03358 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msx2Q03358 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msx2Q03358 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msx2Q03358 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msx2Q03358 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msx2Q03358 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msx2Q03358 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msx2Q03358 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msx2Q03358 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msx2Q03358 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msx2Q03358 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msx2Q03358 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msx2Q03358 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msx2Q03358 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msx2Q03358 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msx2Q03358 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msx2Q03358 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msx2Q03358 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msx2Q03358 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msx2Q03358 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msx2Q03358 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msx2Q03358 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msx2Q03358 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msx2Q03358 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msx2Q03358 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msx2Q03358 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msx2Q03358 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msx2Q03358 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msx2Q03358 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msx2Q03358 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msx2Q03358 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msx2Q03358 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msx2Q03358 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msx2Q03358 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msx2Q03358 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msx2Q03358 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msx2Q03358 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msx2Q03358 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msx2Q03358 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msx2Q03358 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msx2Q03358 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Msx2Q03358 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Msx2Q03358 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Msx2Q03358 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Msx2Q03358 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Msx2Q03358 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Msx2Q03358 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Msx2Q03358 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Msx2Q03358 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Msx2Q03358 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Msx2Q03358 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Msx2Q03358 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Msx2Q03358 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Msx2Q03358 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Msx2Q03358 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Msx2Q03358 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Msx2Q03358 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Msx2Q03358 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Msx2Q03358 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Msx2Q03358 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Msx2Q03358 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Msx2Q03358 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Msx2Q03358 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Msx2Q03358 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Msx2Q03358 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Msx2Q03358 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Msx2Q03358 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Msx2Q03358 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Msx2Q03358 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Msx2Q03358 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Msx2Q03358 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Msx2Q03358 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Msx2Q03358 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Msx2Q03358 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Msx2Q03358 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Msx2Q03358 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Msx2Q03358 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Msx2Q03358 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Msx2Q03358 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms