Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Thbs2Q03350 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms