Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Col6a2Q02788 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Col6a2Q02788 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Col6a2Q02788 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Col6a2Q02788 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Col6a2Q02788 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Col6a2Q02788 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col6a2Q02788 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col6a2Q02788 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col6a2Q02788 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col6a2Q02788 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col6a2Q02788 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col6a2Q02788 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col6a2Q02788 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col6a2Q02788 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col6a2Q02788 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col6a2Q02788 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Col6a2Q02788 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col6a2Q02788 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col6a2Q02788 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col6a2Q02788 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col6a2Q02788 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col6a2Q02788 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col6a2Q02788 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col6a2Q02788 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col6a2Q02788 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col6a2Q02788 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col6a2Q02788 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col6a2Q02788 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col6a2Q02788 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col6a2Q02788 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col6a2Q02788 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col6a2Q02788 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col6a2Q02788 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col6a2Q02788 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col6a2Q02788 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col6a2Q02788 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Col6a2Q02788 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col6a2Q02788 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col6a2Q02788 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col6a2Q02788 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col6a2Q02788 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col6a2Q02788 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col6a2Q02788 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col6a2Q02788 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col6a2Q02788 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Col6a2Q02788 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Col6a2Q02788 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Col6a2Q02788 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Col6a2Q02788 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Col6a2Q02788 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Col6a2Q02788 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Col6a2Q02788 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Col6a2Q02788 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Col6a2Q02788 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Col6a2Q02788 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Col6a2Q02788 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Col6a2Q02788 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Col6a2Q02788 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Col6a2Q02788 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Col6a2Q02788 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.2 ms