Protein–RNA interactions for Protein: Q02284

Htr1f, 5-hydroxytryptamine receptor 1F, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr1fQ02284 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Htr1fQ02284 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Htr1fQ02284 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htr1fQ02284 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Htr1fQ02284 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htr1fQ02284 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htr1fQ02284 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htr1fQ02284 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htr1fQ02284 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htr1fQ02284 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htr1fQ02284 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htr1fQ02284 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htr1fQ02284 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Htr1fQ02284 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htr1fQ02284 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htr1fQ02284 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htr1fQ02284 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htr1fQ02284 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htr1fQ02284 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htr1fQ02284 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htr1fQ02284 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Htr1fQ02284 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Htr1fQ02284 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Htr1fQ02284 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Htr1fQ02284 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Htr1fQ02284 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Htr1fQ02284 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Htr1fQ02284 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Htr1fQ02284 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Htr1fQ02284 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Htr1fQ02284 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Htr1fQ02284 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Htr1fQ02284 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Htr1fQ02284 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Htr1fQ02284 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Htr1fQ02284 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Htr1fQ02284 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Htr1fQ02284 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Htr1fQ02284 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Htr1fQ02284 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Htr1fQ02284 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Htr1fQ02284 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Htr1fQ02284 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Htr1fQ02284 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htr1fQ02284 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htr1fQ02284 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htr1fQ02284 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htr1fQ02284 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htr1fQ02284 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htr1fQ02284 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htr1fQ02284 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Htr1fQ02284 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htr1fQ02284 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htr1fQ02284 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htr1fQ02284 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htr1fQ02284 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms