Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Top2aQ01320 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Top2aQ01320 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Top2aQ01320 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Top2aQ01320 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Top2aQ01320 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Top2aQ01320 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Top2aQ01320 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Top2aQ01320 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Top2aQ01320 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Top2aQ01320 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Top2aQ01320 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Top2aQ01320 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Top2aQ01320 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Top2aQ01320 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Top2aQ01320 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Top2aQ01320 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Top2aQ01320 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Top2aQ01320 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Top2aQ01320 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Top2aQ01320 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Top2aQ01320 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Top2aQ01320 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Top2aQ01320 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Top2aQ01320 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Top2aQ01320 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Top2aQ01320 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Top2aQ01320 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Top2aQ01320 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Top2aQ01320 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Top2aQ01320 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Top2aQ01320 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Top2aQ01320 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Top2aQ01320 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Top2aQ01320 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Top2aQ01320 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Top2aQ01320 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Top2aQ01320 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Top2aQ01320 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Top2aQ01320 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Top2aQ01320 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Top2aQ01320 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Top2aQ01320 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Top2aQ01320 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Top2aQ01320 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Top2aQ01320 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Top2aQ01320 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Top2aQ01320 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Top2aQ01320 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Top2aQ01320 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Top2aQ01320 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Top2aQ01320 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Top2aQ01320 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Top2aQ01320 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Top2aQ01320 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Top2aQ01320 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Top2aQ01320 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Top2aQ01320 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Top2aQ01320 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Top2aQ01320 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Top2aQ01320 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Top2aQ01320 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Top2aQ01320 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Top2aQ01320 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Top2aQ01320 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Top2aQ01320 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Top2aQ01320 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Top2aQ01320 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Top2aQ01320 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Top2aQ01320 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Top2aQ01320 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Top2aQ01320 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Top2aQ01320 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Top2aQ01320 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Top2aQ01320 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Top2aQ01320 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Top2aQ01320 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Top2aQ01320 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Top2aQ01320 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Top2aQ01320 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Top2aQ01320 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Top2aQ01320 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Top2aQ01320 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Top2aQ01320 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Top2aQ01320 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Top2aQ01320 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Top2aQ01320 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Top2aQ01320 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Top2aQ01320 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Top2aQ01320 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Top2aQ01320 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Top2aQ01320 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Top2aQ01320 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Top2aQ01320 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Top2aQ01320 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Top2aQ01320 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Top2aQ01320 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Top2aQ01320 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Top2aQ01320 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Top2aQ01320 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms