Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Pde1bQ01065 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pde1bQ01065 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pde1bQ01065 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pde1bQ01065 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pde1bQ01065 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pde1bQ01065 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pde1bQ01065 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pde1bQ01065 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pde1bQ01065 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Pde1bQ01065 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pde1bQ01065 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pde1bQ01065 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pde1bQ01065 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pde1bQ01065 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pde1bQ01065 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pde1bQ01065 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pde1bQ01065 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pde1bQ01065 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pde1bQ01065 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pde1bQ01065 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pde1bQ01065 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pde1bQ01065 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pde1bQ01065 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pde1bQ01065 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pde1bQ01065 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pde1bQ01065 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pde1bQ01065 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pde1bQ01065 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pde1bQ01065 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pde1bQ01065 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Pde1bQ01065 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pde1bQ01065 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Pde1bQ01065 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pde1bQ01065 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pde1bQ01065 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pde1bQ01065 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pde1bQ01065 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pde1bQ01065 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pde1bQ01065 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pde1bQ01065 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pde1bQ01065 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pde1bQ01065 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pde1bQ01065 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pde1bQ01065 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pde1bQ01065 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pde1bQ01065 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pde1bQ01065 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pde1bQ01065 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pde1bQ01065 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pde1bQ01065 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pde1bQ01065 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pde1bQ01065 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Pde1bQ01065 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pde1bQ01065 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pde1bQ01065 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pde1bQ01065 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pde1bQ01065 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pde1bQ01065 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pde1bQ01065 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pde1bQ01065 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pde1bQ01065 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pde1bQ01065 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pde1bQ01065 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pde1bQ01065 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pde1bQ01065 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pde1bQ01065 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pde1bQ01065 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pde1bQ01065 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pde1bQ01065 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pde1bQ01065 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms