Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.39
PrcdQ00LT2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms