Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gabpb1Q00420 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gabpb1Q00420 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gabpb1Q00420 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gabpb1Q00420 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gabpb1Q00420 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gabpb1Q00420 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gabpb1Q00420 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gabpb1Q00420 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gabpb1Q00420 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gabpb1Q00420 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gabpb1Q00420 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gabpb1Q00420 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gabpb1Q00420 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gabpb1Q00420 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gabpb1Q00420 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gabpb1Q00420 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gabpb1Q00420 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gabpb1Q00420 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gabpb1Q00420 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gabpb1Q00420 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gabpb1Q00420 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gabpb1Q00420 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gabpb1Q00420 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gabpb1Q00420 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gabpb1Q00420 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gabpb1Q00420 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gabpb1Q00420 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gabpb1Q00420 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabpb1Q00420 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabpb1Q00420 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabpb1Q00420 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabpb1Q00420 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabpb1Q00420 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabpb1Q00420 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabpb1Q00420 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabpb1Q00420 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabpb1Q00420 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabpb1Q00420 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabpb1Q00420 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabpb1Q00420 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabpb1Q00420 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabpb1Q00420 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabpb1Q00420 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gabpb1Q00420 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gabpb1Q00420 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gabpb1Q00420 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Gabpb1Q00420 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gabpb1Q00420 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gabpb1Q00420 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gabpb1Q00420 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gabpb1Q00420 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gabpb1Q00420 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gabpb1Q00420 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gabpb1Q00420 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gabpb1Q00420 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gabpb1Q00420 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gabpb1Q00420 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gabpb1Q00420 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gabpb1Q00420 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gabpb1Q00420 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gabpb1Q00420 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gabpb1Q00420 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabpb1Q00420 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabpb1Q00420 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabpb1Q00420 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabpb1Q00420 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabpb1Q00420 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabpb1Q00420 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabpb1Q00420 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabpb1Q00420 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabpb1Q00420 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabpb1Q00420 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabpb1Q00420 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabpb1Q00420 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabpb1Q00420 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabpb1Q00420 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabpb1Q00420 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabpb1Q00420 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabpb1Q00420 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabpb1Q00420 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabpb1Q00420 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabpb1Q00420 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabpb1Q00420 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabpb1Q00420 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabpb1Q00420 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabpb1Q00420 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabpb1Q00420 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabpb1Q00420 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabpb1Q00420 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabpb1Q00420 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabpb1Q00420 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabpb1Q00420 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabpb1Q00420 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabpb1Q00420 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabpb1Q00420 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabpb1Q00420 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabpb1Q00420 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabpb1Q00420 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabpb1Q00420 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms