Protein–RNA interactions for Protein: P98156

Vldlr, Very low-density lipoprotein receptor, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VldlrP98156 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
VldlrP98156 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VldlrP98156 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VldlrP98156 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VldlrP98156 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VldlrP98156 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VldlrP98156 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VldlrP98156 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VldlrP98156 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VldlrP98156 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VldlrP98156 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VldlrP98156 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
VldlrP98156 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VldlrP98156 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
VldlrP98156 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VldlrP98156 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VldlrP98156 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VldlrP98156 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VldlrP98156 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
VldlrP98156 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VldlrP98156 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VldlrP98156 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VldlrP98156 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VldlrP98156 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VldlrP98156 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VldlrP98156 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VldlrP98156 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VldlrP98156 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VldlrP98156 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VldlrP98156 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VldlrP98156 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VldlrP98156 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VldlrP98156 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VldlrP98156 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VldlrP98156 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VldlrP98156 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VldlrP98156 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VldlrP98156 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VldlrP98156 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VldlrP98156 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VldlrP98156 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
VldlrP98156 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
VldlrP98156 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VldlrP98156 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VldlrP98156 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VldlrP98156 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VldlrP98156 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VldlrP98156 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VldlrP98156 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VldlrP98156 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VldlrP98156 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VldlrP98156 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VldlrP98156 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VldlrP98156 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VldlrP98156 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VldlrP98156 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VldlrP98156 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VldlrP98156 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VldlrP98156 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VldlrP98156 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VldlrP98156 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VldlrP98156 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VldlrP98156 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VldlrP98156 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VldlrP98156 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VldlrP98156 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VldlrP98156 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VldlrP98156 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VldlrP98156 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VldlrP98156 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VldlrP98156 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
VldlrP98156 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VldlrP98156 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
VldlrP98156 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VldlrP98156 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VldlrP98156 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VldlrP98156 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VldlrP98156 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VldlrP98156 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VldlrP98156 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VldlrP98156 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VldlrP98156 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VldlrP98156 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VldlrP98156 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VldlrP98156 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
VldlrP98156 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VldlrP98156 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VldlrP98156 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VldlrP98156 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VldlrP98156 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VldlrP98156 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VldlrP98156 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VldlrP98156 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VldlrP98156 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VldlrP98156 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VldlrP98156 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VldlrP98156 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VldlrP98156 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VldlrP98156 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VldlrP98156 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms