Protein–RNA interactions for Protein: P98084

Apba2, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 2, mousemouse

Predictions only

Length 750 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba2P98084 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apba2P98084 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apba2P98084 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apba2P98084 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apba2P98084 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apba2P98084 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apba2P98084 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apba2P98084 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apba2P98084 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apba2P98084 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apba2P98084 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apba2P98084 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apba2P98084 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apba2P98084 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apba2P98084 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Apba2P98084 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apba2P98084 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Apba2P98084 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Apba2P98084 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apba2P98084 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apba2P98084 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apba2P98084 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apba2P98084 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apba2P98084 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apba2P98084 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apba2P98084 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Apba2P98084 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Apba2P98084 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Apba2P98084 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Apba2P98084 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Apba2P98084 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Apba2P98084 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Apba2P98084 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Apba2P98084 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Apba2P98084 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Apba2P98084 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Apba2P98084 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apba2P98084 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apba2P98084 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apba2P98084 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apba2P98084 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apba2P98084 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apba2P98084 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apba2P98084 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apba2P98084 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apba2P98084 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apba2P98084 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apba2P98084 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apba2P98084 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apba2P98084 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apba2P98084 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apba2P98084 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Apba2P98084 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Apba2P98084 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Apba2P98084 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Apba2P98084 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Apba2P98084 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Apba2P98084 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Apba2P98084 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Apba2P98084 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Apba2P98084 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apba2P98084 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apba2P98084 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apba2P98084 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Apba2P98084 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apba2P98084 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apba2P98084 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apba2P98084 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apba2P98084 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apba2P98084 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Apba2P98084 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apba2P98084 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apba2P98084 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apba2P98084 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apba2P98084 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apba2P98084 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apba2P98084 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apba2P98084 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apba2P98084 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apba2P98084 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apba2P98084 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apba2P98084 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apba2P98084 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apba2P98084 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apba2P98084 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apba2P98084 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apba2P98084 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apba2P98084 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Apba2P98084 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apba2P98084 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apba2P98084 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apba2P98084 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apba2P98084 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apba2P98084 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apba2P98084 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apba2P98084 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apba2P98084 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apba2P98084 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Apba2P98084 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Apba2P98084 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms