Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms