Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nbr1P97432 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Nbr1P97432 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Nbr1P97432 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nbr1P97432 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nbr1P97432 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Nbr1P97432 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nbr1P97432 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nbr1P97432 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nbr1P97432 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nbr1P97432 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nbr1P97432 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nbr1P97432 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nbr1P97432 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nbr1P97432 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Nbr1P97432 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nbr1P97432 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nbr1P97432 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nbr1P97432 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nbr1P97432 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nbr1P97432 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nbr1P97432 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nbr1P97432 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nbr1P97432 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nbr1P97432 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nbr1P97432 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nbr1P97432 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nbr1P97432 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nbr1P97432 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nbr1P97432 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nbr1P97432 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nbr1P97432 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nbr1P97432 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nbr1P97432 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nbr1P97432 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nbr1P97432 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nbr1P97432 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nbr1P97432 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Nbr1P97432 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nbr1P97432 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nbr1P97432 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nbr1P97432 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nbr1P97432 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nbr1P97432 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nbr1P97432 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nbr1P97432 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nbr1P97432 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nbr1P97432 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nbr1P97432 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nbr1P97432 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nbr1P97432 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nbr1P97432 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Nbr1P97432 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nbr1P97432 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Nbr1P97432 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nbr1P97432 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nbr1P97432 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nbr1P97432 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nbr1P97432 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nbr1P97432 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nbr1P97432 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nbr1P97432 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nbr1P97432 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nbr1P97432 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nbr1P97432 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nbr1P97432 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nbr1P97432 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nbr1P97432 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nbr1P97432 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Nbr1P97432 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nbr1P97432 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nbr1P97432 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nbr1P97432 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nbr1P97432 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nbr1P97432 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nbr1P97432 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nbr1P97432 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nbr1P97432 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nbr1P97432 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nbr1P97432 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nbr1P97432 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nbr1P97432 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nbr1P97432 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Nbr1P97432 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nbr1P97432 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Nbr1P97432 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Nbr1P97432 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nbr1P97432 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nbr1P97432 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nbr1P97432 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nbr1P97432 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nbr1P97432 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nbr1P97432 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nbr1P97432 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nbr1P97432 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nbr1P97432 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nbr1P97432 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nbr1P97432 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nbr1P97432 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nbr1P97432 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms