Protein–RNA interactions for Protein: P97298

Serpinf1, Pigment epithelium-derived factor, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpinf1P97298 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Serpinf1P97298 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Serpinf1P97298 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Serpinf1P97298 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Serpinf1P97298 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Serpinf1P97298 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Serpinf1P97298 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Serpinf1P97298 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Serpinf1P97298 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Serpinf1P97298 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Serpinf1P97298 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Serpinf1P97298 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Serpinf1P97298 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Serpinf1P97298 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Serpinf1P97298 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Serpinf1P97298 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Serpinf1P97298 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Serpinf1P97298 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Serpinf1P97298 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Serpinf1P97298 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Serpinf1P97298 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Serpinf1P97298 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Serpinf1P97298 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Serpinf1P97298 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Serpinf1P97298 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Serpinf1P97298 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Serpinf1P97298 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Serpinf1P97298 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Serpinf1P97298 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Serpinf1P97298 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Serpinf1P97298 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Serpinf1P97298 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Serpinf1P97298 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Serpinf1P97298 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Serpinf1P97298 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Serpinf1P97298 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Serpinf1P97298 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Serpinf1P97298 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Serpinf1P97298 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Serpinf1P97298 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Serpinf1P97298 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Serpinf1P97298 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Serpinf1P97298 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Serpinf1P97298 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Serpinf1P97298 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Serpinf1P97298 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Serpinf1P97298 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Serpinf1P97298 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Serpinf1P97298 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Serpinf1P97298 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Serpinf1P97298 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Serpinf1P97298 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Serpinf1P97298 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Serpinf1P97298 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Serpinf1P97298 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Serpinf1P97298 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Serpinf1P97298 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Serpinf1P97298 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Serpinf1P97298 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Serpinf1P97298 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Serpinf1P97298 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Serpinf1P97298 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Serpinf1P97298 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Serpinf1P97298 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Serpinf1P97298 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Serpinf1P97298 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Serpinf1P97298 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Serpinf1P97298 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Serpinf1P97298 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Serpinf1P97298 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Serpinf1P97298 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Serpinf1P97298 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Serpinf1P97298 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Serpinf1P97298 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Serpinf1P97298 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Serpinf1P97298 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Serpinf1P97298 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Serpinf1P97298 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Serpinf1P97298 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Serpinf1P97298 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Serpinf1P97298 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Serpinf1P97298 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Serpinf1P97298 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Serpinf1P97298 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Serpinf1P97298 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Serpinf1P97298 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Serpinf1P97298 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Serpinf1P97298 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Serpinf1P97298 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Serpinf1P97298 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Serpinf1P97298 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Serpinf1P97298 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Serpinf1P97298 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Serpinf1P97298 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Serpinf1P97298 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Serpinf1P97298 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Serpinf1P97298 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Serpinf1P97298 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Serpinf1P97298 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Serpinf1P97298 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms