Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Irx1P81068 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Irx1P81068 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Irx1P81068 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Irx1P81068 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Irx1P81068 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Irx1P81068 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Irx1P81068 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Irx1P81068 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Irx1P81068 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Irx1P81068 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Irx1P81068 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Irx1P81068 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Irx1P81068 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Irx1P81068 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Irx1P81068 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Irx1P81068 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Irx1P81068 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Irx1P81068 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Irx1P81068 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Irx1P81068 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Irx1P81068 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Irx1P81068 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Irx1P81068 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Irx1P81068 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Irx1P81068 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Irx1P81068 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Irx1P81068 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Irx1P81068 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Irx1P81068 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Irx1P81068 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Irx1P81068 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Irx1P81068 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Irx1P81068 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Irx1P81068 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Irx1P81068 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Irx1P81068 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Irx1P81068 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Irx1P81068 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Irx1P81068 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Irx1P81068 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Irx1P81068 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Irx1P81068 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Irx1P81068 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Irx1P81068 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Irx1P81068 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Irx1P81068 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Irx1P81068 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Irx1P81068 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Irx1P81068 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Irx1P81068 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Irx1P81068 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Irx1P81068 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Irx1P81068 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Irx1P81068 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Irx1P81068 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Irx1P81068 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Irx1P81068 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Irx1P81068 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Irx1P81068 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Irx1P81068 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Irx1P81068 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Irx1P81068 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Irx1P81068 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Irx1P81068 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Irx1P81068 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Irx1P81068 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Irx1P81068 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Irx1P81068 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Irx1P81068 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Irx1P81068 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Irx1P81068 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Irx1P81068 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Irx1P81068 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Irx1P81068 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Irx1P81068 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx1P81068 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx1P81068 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx1P81068 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx1P81068 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx1P81068 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx1P81068 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx1P81068 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx1P81068 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx1P81068 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx1P81068 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx1P81068 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx1P81068 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx1P81068 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx1P81068 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx1P81068 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx1P81068 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx1P81068 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx1P81068 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx1P81068 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irx1P81068 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irx1P81068 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irx1P81068 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irx1P81068 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irx1P81068 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms