Protein–RNA interactions for Protein: P80316

Cct5, T-complex protein 1 subunit epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cct5P80316 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Cct5P80316 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cct5P80316 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Cct5P80316 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cct5P80316 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cct5P80316 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cct5P80316 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cct5P80316 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cct5P80316 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cct5P80316 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cct5P80316 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cct5P80316 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cct5P80316 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cct5P80316 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cct5P80316 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cct5P80316 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cct5P80316 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cct5P80316 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cct5P80316 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cct5P80316 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cct5P80316 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cct5P80316 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cct5P80316 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cct5P80316 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cct5P80316 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cct5P80316 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cct5P80316 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cct5P80316 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cct5P80316 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cct5P80316 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cct5P80316 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cct5P80316 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cct5P80316 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cct5P80316 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cct5P80316 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cct5P80316 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cct5P80316 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cct5P80316 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cct5P80316 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cct5P80316 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cct5P80316 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cct5P80316 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cct5P80316 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cct5P80316 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cct5P80316 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cct5P80316 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cct5P80316 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cct5P80316 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cct5P80316 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cct5P80316 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cct5P80316 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cct5P80316 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cct5P80316 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cct5P80316 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cct5P80316 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cct5P80316 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cct5P80316 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cct5P80316 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cct5P80316 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cct5P80316 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cct5P80316 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cct5P80316 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cct5P80316 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cct5P80316 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cct5P80316 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cct5P80316 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cct5P80316 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cct5P80316 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cct5P80316 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cct5P80316 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cct5P80316 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cct5P80316 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cct5P80316 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cct5P80316 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cct5P80316 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cct5P80316 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cct5P80316 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cct5P80316 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cct5P80316 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cct5P80316 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cct5P80316 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cct5P80316 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cct5P80316 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cct5P80316 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cct5P80316 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cct5P80316 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cct5P80316 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cct5P80316 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cct5P80316 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cct5P80316 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cct5P80316 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cct5P80316 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cct5P80316 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cct5P80316 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cct5P80316 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cct5P80316 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cct5P80316 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cct5P80316 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cct5P80316 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cct5P80316 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms