Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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