Protein–RNA interactions for Protein: P70278

Stra8, Stimulated by retinoic acid gene 8 protein, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra8P70278 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Stra8P70278 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Stra8P70278 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Stra8P70278 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Stra8P70278 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Stra8P70278 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Stra8P70278 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Stra8P70278 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Stra8P70278 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Stra8P70278 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Stra8P70278 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Stra8P70278 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Stra8P70278 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Stra8P70278 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Stra8P70278 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Stra8P70278 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Stra8P70278 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Stra8P70278 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Stra8P70278 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Stra8P70278 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Stra8P70278 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Stra8P70278 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Stra8P70278 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Stra8P70278 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Stra8P70278 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Stra8P70278 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Stra8P70278 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Stra8P70278 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Stra8P70278 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Stra8P70278 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Stra8P70278 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Stra8P70278 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Stra8P70278 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Stra8P70278 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Stra8P70278 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Stra8P70278 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Stra8P70278 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Stra8P70278 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Stra8P70278 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Stra8P70278 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Stra8P70278 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Stra8P70278 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Stra8P70278 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Stra8P70278 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Stra8P70278 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Stra8P70278 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Stra8P70278 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Stra8P70278 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Stra8P70278 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Stra8P70278 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Stra8P70278 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Stra8P70278 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Stra8P70278 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Stra8P70278 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Stra8P70278 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Stra8P70278 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Stra8P70278 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Stra8P70278 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Stra8P70278 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Stra8P70278 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Stra8P70278 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Stra8P70278 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Stra8P70278 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Stra8P70278 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Stra8P70278 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Stra8P70278 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Stra8P70278 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Stra8P70278 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Stra8P70278 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Stra8P70278 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Stra8P70278 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Stra8P70278 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Stra8P70278 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Stra8P70278 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Stra8P70278 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Stra8P70278 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Stra8P70278 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Stra8P70278 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Stra8P70278 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Stra8P70278 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Stra8P70278 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Stra8P70278 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Stra8P70278 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Stra8P70278 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Stra8P70278 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Stra8P70278 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Stra8P70278 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Stra8P70278 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Stra8P70278 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Stra8P70278 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Stra8P70278 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Stra8P70278 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Stra8P70278 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Stra8P70278 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Stra8P70278 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Stra8P70278 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Stra8P70278 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Stra8P70278 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Stra8P70278 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Stra8P70278 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms