Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxd13P70217 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxd13P70217 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxd13P70217 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxd13P70217 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxd13P70217 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxd13P70217 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxd13P70217 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxd13P70217 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxd13P70217 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxd13P70217 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxd13P70217 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxd13P70217 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd13P70217 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd13P70217 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd13P70217 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd13P70217 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd13P70217 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd13P70217 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd13P70217 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd13P70217 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd13P70217 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd13P70217 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd13P70217 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd13P70217 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxd13P70217 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxd13P70217 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxd13P70217 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxd13P70217 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxd13P70217 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxd13P70217 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxd13P70217 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxd13P70217 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxd13P70217 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxd13P70217 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxd13P70217 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxd13P70217 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxd13P70217 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxd13P70217 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxd13P70217 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxd13P70217 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxd13P70217 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxd13P70217 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxd13P70217 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxd13P70217 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxd13P70217 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxd13P70217 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxd13P70217 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Hoxd13P70217 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxd13P70217 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxd13P70217 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxd13P70217 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxd13P70217 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxd13P70217 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxd13P70217 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxd13P70217 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxd13P70217 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxd13P70217 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxd13P70217 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxd13P70217 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxd13P70217 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxd13P70217 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxd13P70217 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxd13P70217 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxd13P70217 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxd13P70217 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxd13P70217 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxd13P70217 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxd13P70217 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxd13P70217 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxd13P70217 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxd13P70217 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxd13P70217 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxd13P70217 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxd13P70217 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxd13P70217 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxd13P70217 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxd13P70217 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxd13P70217 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxd13P70217 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxd13P70217 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxd13P70217 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxd13P70217 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxd13P70217 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxd13P70217 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxd13P70217 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxd13P70217 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxd13P70217 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxd13P70217 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxd13P70217 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxd13P70217 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxd13P70217 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxd13P70217 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxd13P70217 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxd13P70217 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxd13P70217 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxd13P70217 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxd13P70217 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxd13P70217 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxd13P70217 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms