Protein–RNA interactions for Protein: P70196

Traf6, TNF receptor-associated factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf6P70196 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Traf6P70196 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Traf6P70196 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Traf6P70196 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Traf6P70196 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf6P70196 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf6P70196 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf6P70196 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf6P70196 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf6P70196 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf6P70196 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf6P70196 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf6P70196 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf6P70196 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf6P70196 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf6P70196 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf6P70196 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf6P70196 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf6P70196 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf6P70196 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf6P70196 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf6P70196 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf6P70196 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf6P70196 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf6P70196 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf6P70196 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf6P70196 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Traf6P70196 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Traf6P70196 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Traf6P70196 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Traf6P70196 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Traf6P70196 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Traf6P70196 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Traf6P70196 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Traf6P70196 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Traf6P70196 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Traf6P70196 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Traf6P70196 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Traf6P70196 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Traf6P70196 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Traf6P70196 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Traf6P70196 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Traf6P70196 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Traf6P70196 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Traf6P70196 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Traf6P70196 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Traf6P70196 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Traf6P70196 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Traf6P70196 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Traf6P70196 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Traf6P70196 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Traf6P70196 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Traf6P70196 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Traf6P70196 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Traf6P70196 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Traf6P70196 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Traf6P70196 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Traf6P70196 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Traf6P70196 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Traf6P70196 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Traf6P70196 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Traf6P70196 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Traf6P70196 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Traf6P70196 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Traf6P70196 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Traf6P70196 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Traf6P70196 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Traf6P70196 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Traf6P70196 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Traf6P70196 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Traf6P70196 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Traf6P70196 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Traf6P70196 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Traf6P70196 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Traf6P70196 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf6P70196 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf6P70196 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf6P70196 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf6P70196 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf6P70196 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf6P70196 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf6P70196 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf6P70196 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf6P70196 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf6P70196 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf6P70196 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf6P70196 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf6P70196 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf6P70196 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf6P70196 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf6P70196 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Traf6P70196 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Traf6P70196 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Traf6P70196 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Traf6P70196 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Traf6P70196 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Traf6P70196 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Traf6P70196 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Traf6P70196 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Traf6P70196 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms