Protein–RNA interactions for Protein: P63254

Crip1, Cysteine-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crip1P63254 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Crip1P63254 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Crip1P63254 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Crip1P63254 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Crip1P63254 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Crip1P63254 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Crip1P63254 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Crip1P63254 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Crip1P63254 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Crip1P63254 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Crip1P63254 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Crip1P63254 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Crip1P63254 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Crip1P63254 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Crip1P63254 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Crip1P63254 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Crip1P63254 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Crip1P63254 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Crip1P63254 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Crip1P63254 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Crip1P63254 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Crip1P63254 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Crip1P63254 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Crip1P63254 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Crip1P63254 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Crip1P63254 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Crip1P63254 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Crip1P63254 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Crip1P63254 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Crip1P63254 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Crip1P63254 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Crip1P63254 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Crip1P63254 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Crip1P63254 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Crip1P63254 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Crip1P63254 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Crip1P63254 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Crip1P63254 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Crip1P63254 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Crip1P63254 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Crip1P63254 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Crip1P63254 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Crip1P63254 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Crip1P63254 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Crip1P63254 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Crip1P63254 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Crip1P63254 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Crip1P63254 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Crip1P63254 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Crip1P63254 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Crip1P63254 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Crip1P63254 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Crip1P63254 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Crip1P63254 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Crip1P63254 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Crip1P63254 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Crip1P63254 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Crip1P63254 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Crip1P63254 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Crip1P63254 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Crip1P63254 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Crip1P63254 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Crip1P63254 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Crip1P63254 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Crip1P63254 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Crip1P63254 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Crip1P63254 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Crip1P63254 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Crip1P63254 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Crip1P63254 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Crip1P63254 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Crip1P63254 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Crip1P63254 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Crip1P63254 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Crip1P63254 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Crip1P63254 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Crip1P63254 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Crip1P63254 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Crip1P63254 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Crip1P63254 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Crip1P63254 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Crip1P63254 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Crip1P63254 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Crip1P63254 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Crip1P63254 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Crip1P63254 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Crip1P63254 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Crip1P63254 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Crip1P63254 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Crip1P63254 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Crip1P63254 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Crip1P63254 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Crip1P63254 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Crip1P63254 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Crip1P63254 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Crip1P63254 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Crip1P63254 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Crip1P63254 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Crip1P63254 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Crip1P63254 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms