Protein–RNA interactions for Protein: P63013

Prrx1, Paired mesoderm homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx1P63013 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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