Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vsnl1P62761 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vsnl1P62761 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vsnl1P62761 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vsnl1P62761 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vsnl1P62761 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vsnl1P62761 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vsnl1P62761 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vsnl1P62761 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vsnl1P62761 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vsnl1P62761 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vsnl1P62761 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vsnl1P62761 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vsnl1P62761 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vsnl1P62761 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vsnl1P62761 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vsnl1P62761 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vsnl1P62761 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vsnl1P62761 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vsnl1P62761 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vsnl1P62761 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vsnl1P62761 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vsnl1P62761 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Vsnl1P62761 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vsnl1P62761 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Vsnl1P62761 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vsnl1P62761 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vsnl1P62761 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vsnl1P62761 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vsnl1P62761 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vsnl1P62761 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vsnl1P62761 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vsnl1P62761 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vsnl1P62761 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vsnl1P62761 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vsnl1P62761 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Vsnl1P62761 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Vsnl1P62761 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Vsnl1P62761 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vsnl1P62761 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vsnl1P62761 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vsnl1P62761 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vsnl1P62761 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Vsnl1P62761 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vsnl1P62761 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vsnl1P62761 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vsnl1P62761 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vsnl1P62761 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vsnl1P62761 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vsnl1P62761 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vsnl1P62761 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vsnl1P62761 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vsnl1P62761 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vsnl1P62761 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vsnl1P62761 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vsnl1P62761 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Vsnl1P62761 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vsnl1P62761 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vsnl1P62761 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vsnl1P62761 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vsnl1P62761 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vsnl1P62761 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vsnl1P62761 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Vsnl1P62761 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vsnl1P62761 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vsnl1P62761 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Vsnl1P62761 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Vsnl1P62761 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vsnl1P62761 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vsnl1P62761 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vsnl1P62761 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vsnl1P62761 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vsnl1P62761 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vsnl1P62761 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Vsnl1P62761 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vsnl1P62761 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vsnl1P62761 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vsnl1P62761 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vsnl1P62761 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vsnl1P62761 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vsnl1P62761 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vsnl1P62761 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vsnl1P62761 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vsnl1P62761 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vsnl1P62761 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vsnl1P62761 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vsnl1P62761 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vsnl1P62761 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vsnl1P62761 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vsnl1P62761 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vsnl1P62761 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vsnl1P62761 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vsnl1P62761 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vsnl1P62761 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vsnl1P62761 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vsnl1P62761 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vsnl1P62761 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vsnl1P62761 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vsnl1P62761 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vsnl1P62761 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms