Protein–RNA interactions for Protein: P62317

Snrpd2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd2P62317 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snrpd2P62317 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms