Protein–RNA interactions for Protein: P62313

Lsm6, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 80 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm6P62313 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lsm6P62313 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lsm6P62313 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lsm6P62313 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lsm6P62313 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lsm6P62313 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lsm6P62313 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lsm6P62313 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lsm6P62313 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lsm6P62313 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lsm6P62313 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lsm6P62313 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lsm6P62313 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lsm6P62313 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lsm6P62313 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lsm6P62313 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lsm6P62313 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lsm6P62313 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lsm6P62313 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lsm6P62313 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lsm6P62313 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lsm6P62313 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lsm6P62313 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lsm6P62313 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lsm6P62313 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lsm6P62313 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lsm6P62313 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lsm6P62313 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lsm6P62313 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lsm6P62313 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lsm6P62313 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lsm6P62313 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lsm6P62313 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lsm6P62313 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lsm6P62313 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lsm6P62313 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm6P62313 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm6P62313 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm6P62313 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm6P62313 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm6P62313 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm6P62313 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm6P62313 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm6P62313 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm6P62313 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm6P62313 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm6P62313 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm6P62313 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm6P62313 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm6P62313 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm6P62313 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm6P62313 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm6P62313 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm6P62313 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm6P62313 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm6P62313 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm6P62313 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm6P62313 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm6P62313 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm6P62313 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm6P62313 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm6P62313 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm6P62313 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm6P62313 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm6P62313 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm6P62313 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm6P62313 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm6P62313 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm6P62313 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm6P62313 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm6P62313 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm6P62313 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm6P62313 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm6P62313 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm6P62313 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm6P62313 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm6P62313 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm6P62313 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm6P62313 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm6P62313 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm6P62313 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm6P62313 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm6P62313 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm6P62313 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm6P62313 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lsm6P62313 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lsm6P62313 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lsm6P62313 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lsm6P62313 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsm6P62313 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsm6P62313 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsm6P62313 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsm6P62313 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsm6P62313 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsm6P62313 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsm6P62313 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsm6P62313 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsm6P62313 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsm6P62313 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsm6P62313 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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